Sebuah kasus pembunuhan berantai terjadi di Kyoto, melibatkan anggota geng pencuri Genjibotaru. Conan, yang sedang berlibur bersama teman-temannya, harus bekerja sama dengan Heiji dan Kazuha untuk memecahkan misteri ini, terutama karena si pembunuh juga mengincar Heiji.