Cerita Gundam Membangun Fighters Try berseting pada 7 tahun setelah season pertamanya, saat di mana Iori Sei dan Reiji memenangkan Kejuaraan Dunia Gunpla Battle Ke 7. Saat ini, Klub Gunpla Battle Akademi Seiho hanya memiliki satu anggota yaitu Hoshino Fumina, seorang muird kelas tiga di SMP. Sebagai presiden klub, ia membutuhkan dua anggota lainnya untuk berpartisipasi dalam Kejuaraan Gunpla Battle Jepang yang akan datang. Suatu hari dia bertemu seorang murid pindahan bernama Kamiki Sekai, yang telah melakukan perjalanan untuk pelatihan Kenpo dengan gurunya. Kemudian bergabunglah juga seorang perakit gunpla bernama Kousaka Yuuma, tantangan mereka dalam Gunpla telah dimulai ….