Yu-Gi-Oh! ARC-V bercerita tentang Yūya Sakaki, seorang anak laki-laki usia 14 tahun yang ingin kabur dari kenyataan pahit dengan tersenyum, namun satu duel mengubahnya untuk menghadapi kesulitan dengan tekad kuat, mengusung tema "Melangkah maju dengan berani!!". Serial ini mengeksplorasi konsep Empat Dimensi (Standard, Fusion, Synchro, Xyz) yang mencerminkan seri Yu-Gi-Oh! sebelumnya, dengan Yūya harus mengatasi konflik antar dimensi dan menemukan kekuatan tak terbatas untuk menyelamatkan dunia.